Florian Lejeune del Rayo Vallecano è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in LaLiga nel 2024/2025, avendo collezionato 37 presenze, per un totale di 3326 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in tutte le 37 presenze, su 38 giornate.
La sua ultima partita in campionato è stata il 24 maggio, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Rayo Vallecano contro il Maiorca, nel pareggio per 0-0. In totale il difensore ha realizzato 2 reti in questa stagione; ha inoltre fornito 3 assist. Ha ricevuto 8 cartellini gialli.
L'ultimo gol di Lejeune in campionato è arrivato nel pareggio 2-2 contro il Real Betis, il 15 maggio. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Getafe il 2 maggio, con una rete nella vittoria per 1-0.
Lejeune ha giocato 37 partite di LaLiga nell'ultima stagione con il Rayo Vallecano, gare in cui ha realizzato 3 gol e fornito 1 assist.
A luglio 2022 Lejeune, in quel periodo giocatore del Deportivo Alavés, ha iniziato a giocare per il Rayo Vallecano in prestito. Ha collezionato 30 presenze in campionato in totale con il Deportivo Alavés. Il suo passaggio a giocatore del Rayo Vallecano è stato definitivo a luglio 2023.
Il 6 novembre 2011 Lejeune ha esordito in LaLiga con il Villarreal, all'età di 20 anni e 170 giorni, contro l'Espanyol. La prima presenza con il suo club attuale, il Rayo Vallecano, in LaLiga è stata nella gara contro il Barcellona il 13 agosto 2022.
Finora in LaLiga, ha giocato 205 partite con 11 gol segnati e 6 assist per i compagni. Lejeune è stato espulso 5 volte durante la sua esperienza in LaLiga, oltre ad aver ricevuto 40 cartellini gialli.