Moussa Niakhaté è un difensore del Lione che ha giocato la maggior parte delle gare della sua squadra in Ligue 1 nel 2024/2025, avendo collezionato 24 presenze, per un totale di 2095 minuti. É partito titolare in 23 di queste presenze, su 27 giornate, ed è entrato a gara in corso 1 volta.
La sua ultima apparizione in campionato risale al 28 marzo, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Lione contro lo Strasburgo, nella sconfitta per 4-2.
La prossima sfida per il Lione sarà una sfida casalinga contro il Lilla, il 5 aprile.
Nell'ultima stagione con il Nottingham Forest in Premier League Niakhaté ha collezionato 21 presenze, gare in cui ha segnato 1 gol.
Prima di cominciare l'esperienza con il Lione nel luglio 2024, Niakhaté ha collezionato 35 presenze in campionato con il Nottingham Forest, per un totale di 1 gol.
Il 12 agosto 2017 Niakhaté ha fatto il suo esordio in Ligue 1 con il Metz, a 21 anni e 157 giorni, contro il Bordeaux. La prima presenza con il suo club attuale, il Lione, in Ligue 1 è stata nella partita contro il Rennes il 18 agosto 2024.
In totale, nella sua carriera in Ligue 1, ha giocato 59 partite con un gol con un assist.