Mert Müldür è un difensore del Fenerbahçe che ha giocato nella maggior parte delle partite del club in Süper Lig nel 2025/2026, avendo collezionato 24 presenze, per un totale di 1211 minuti. É partito titolare in 11 presenze su 34 giornate ed è stato utilizzato come subentrato in 13 occasioni.
La sua ultima apparizione nella competizione è stata il 17 maggio, gara in cui ha giocato 63 minuti con la maglia del Fenerbahçe contro Eyüpspor, nel pareggio per 3-3. In totale il difensore ha realizzato 1 rete nel 2025/2026; ha inoltre fornito 2 assist. Ha ricevuto 4 cartellini gialli.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una vittoria 4-0 contro il Konyaspor il 15 dicembre.
Müldür ha giocato 29 partite di Süper Lig nell'ultima stagione con il Fenerbahce, gare in cui ha realizzato 3 gol e fornito 2 assist.
Il difensore ha iniziato la sua esperienza con il Fenerbahce nell'agosto 2023, mentre prima giocava con il Sassuolo, con cui ha collezionato 85 presenze in campionato, con 2 gol e 2 assist.