Jirí Pavlenka è un portiere del PAOK che ha giocato nella maggior parte delle partite della sua squadra in Super League 1 nel 2025/2026, avendo collezionato 20 presenze, per un totale di 1673 minuti. É partito titolare in 20 presenze, su 32 giornate.
Il portiere ha giocato la sua ultima gara il 17 maggio, con il PAOK: un pareggio per 2-2 contro il Panathinaikos, in cui ha giocato 90 minuti. Ha mantenuto 7 volte la porta inviolata in questa stagione.
Nella passata stagione di Super League 1 Pavlenka ha giocato 2 partite con il PAOK, gare in cui ha mantenuto 1 volta la porta inviolata.
Prima di arrivare a vestire la maglia del PAOK nel settembre 2024, il portiere ha collezionato 198 presenze in campionato con il Werder Brema.