Youssouf Ndayishimiye è un centrocampista del Nizza che è sceso in campo nella maggior parte delle partite del club in Ligue 1 nel 2024/2025, avendo collezionato 20 presenze, per un totale di 1663 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 19 presenze su 28 giornate ed è entrato 1 volta.
L'ultima partita di Ndayishimiye in Ligue 1 è stata il 4 aprile, partita in cui ha giocato 90 minuti con la maglia del Nizza contro il Nantes, nella sconfitta per 2-1. In totale il centrocampista ha segnato 1 rete in questa stagione. Ha ricevuto 5 cartellini gialli.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una vittoria 4-1 contro l'Angers l'1 settembre.
Nella prossima partita di Ligue 1, il 12 aprile, il Nizza dovrà giocare una trasferta contro lo Strasburgo.
Nell'ultima stagione con il Nizza in Ligue 1 Ndayishimiye ha collezionato 23 presenze.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Nizza nel gennaio 2023, il centrocampista ha collezionato 58 presenze in campionato con l'Istanbul Ba?ak?ehir, per un totale di 5 reti e 3 assist.
Ndayishimiye ha fatto il suo esordio in Ligue 1 con il Nizza il 29 gennaio 2023 come subentrato contro il Lilla all'età di 24 anni e 94 giorni. In totale, nella sua carriera in Ligue 1, ha collezionato 53 partite, con 2 gol.