Stefan Lainer è un difensore del Salzburg che ha giocato la maggior parte delle partite della sua squadra in Bundesliga nel 2025/2026, avendo collezionato 25 presenze, per un totale di 2081 minuti. É partito titolare in 23 di queste presenze, su 32 giornate, ed è entrato a gara in corso 2 volte.
L'ultima presenza di Lainer risale al 17 maggio, contro l'Hartberg. In quella partita ha fornito un assist vincente nella sconfitta per 3-1. In totale il difensore ha segnato 1 rete in questa stagione; ha inoltre offerto 4 assist. Ha ricevuto 6 cartellini gialli.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una vittoria 2-1 contro l'Hartberg il 16 agosto.
Lainer ha giocato 21 partite di Bundesliga nell'ultima stagione con il Borussia M'gladbach, gare in cui ha segnato 1 gol.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Salzburg nel giugno 2025, il difensore ha collezionato 138 presenze in campionato con il Borussia M'gladbach, per un totale di 5 reti e 8 assist.