Santiago Núñez è un difensore del Estudiantes che ha giocato la maggior parte delle partite della sua squadra in Liga Profesional Argentina nel 2025, avendo collezionato 29 presenze, per un totale di 2354 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 25 di queste presenze, su 36 giornate, ed è entrato a gara in corso 4 volte.
Núñez ha giocato la sua ultima partita l'8 dicembre, con l'Estudiantes: una vittoria per 1-0 contro il Gimnasia La Plata, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il difensore ha segnato 1 gol in questa stagione. Ha ricevuto 12 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 1 volta.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una sconfitta 2-1 contro il River Plate il 13 settembre.
Núñez ha giocato 10 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Club Santos Laguna.
Núñez è passato a giocare con l'Estudiantes nel gennaio 2025, mentre prima giocava con il Club Santos Laguna, con cui ha collezionato 24 presenze in campionato.