Ruben Müller del Paderborn ha giocato nella maggior parte delle partite della sua squadra in 2. Bundesliga nel 2025/2026, avendo collezionato 16 presenze, per un totale di 722 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 8 presenze su 28 giornate ed è stato utilizzato come subentrato in 8 occasioni.
La sua ultima partita in 2. Bundesliga risale al 5 aprile, gara in cui ha giocato 64 minuti con la maglia del Paderborn contro il Greuther Fürth, nella vittoria per 2-0. In questa stagione il centrocampista ha registrato 2 assist.
Nella prossima partita di 2. Bundesliga, il 12 aprile, il Paderborn dovrà giocare una gara casalinga contro Magdeburg.
Müller ha giocato 32 partite di Regionalliga nell'ultima stagione con Freiburg II, realizzando 3 gol.
Prima di cominciare l'esperienza con il Paderborn nel luglio 2025, il centrocampista ha collezionato 32 presenze in campionato con Freiburg II, per un totale di 3 gol.
Il 12 settembre 2025 Müller ha debuttato in 2. Bundesliga, a 20 anni e 19 giorni contro il Bochum. In generale in 2. Bundesliga, ha giocato 16 partite, con 2 assist.