Jonathan Pérez del Nashville SC ha collezionato 22 presenze in questa MLS, con tutte queste che sono state per la sua attuale squadra. Ha giocato anche per i L.A. Galaxy durante la stagione 2025.
Pérez ha collezionato la sua ultima presenza il 13 settembre, con il Nashville: una sconfitta per 2-1 contro il Cincinnati, in cui ha giocato 17 minuti. In totale il centrocampista ha segnato 1 gol in questa stagione; ha inoltre registrato 2 assist. Ha ricevuto 5 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 1 volta.
Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro l'Impact de Montréal il 22 marzo, avendo segnato nella vittoria per 3-0.
La trasferta contro l'Inter Miami, l'8 novembre, sarà la prossima sfida di MLS per il Nashville.
Pérez ha giocato 20 partite di MLS e MLS Next Pro nell'ultima stagione con il Nashville (6), i L.A. Galaxy (6), Ventura County (5), e Huntsville City (3), gare in cui ha realizzato 3 gol e fornito 3 assist.
Il centrocampista è passato a giocare in prestito con il Nashville nel luglio 2024. In precedenza giocava per i L.A. Galaxy, per cui ha collezionato 16 presenze in campionato, con 1 assist, mentre prima giocava per Huntsville City.