Jan-Niklas Beste è un difensore del Friburgo che è sceso in campo in 12 partite di Bundesliga nel 2024/2025 dopo aver raggiunto il club il 31 gennaio 2025, con tutte queste presenze arrivate da subentrato.
Beste ha giocato la sua ultima gara il 4 maggio, con il Friburgo: un pareggio per 2-2 contro il Bayer Leverkusen, in cui ha giocato solo 9 minuti. In totale il difensore ha offerto 1 assist in questa stagione.
Nella passata stagione di Bundesliga Beste ha giocato 31 partite con l'Heidenheim, gare in cui ha segnato 8 gol e fornito 11 assist vincenti.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Friburgo nel gennaio 2025, Beste ha collezionato 13 presenze in campionato con il Benfica, per un totale di 1 assist.
Beste ha avuto un buon impatto nel suo debutto in campionato con l'Heidenheim il 26 agosto 2023. Il difensore ha realizzato un gol nella sua prima presenza nella competizione, contro l'Hoffenheim, all'età di 24 anni e 234 giorni. La prima presenza con la sua attuale squadra, il Friburgo, in Bundesliga è stata nella sfida contro l'Heidenheim l'8 febbraio 2025.
In totale, nella sua carriera in Bundesliga, ha collezionato 43 presenze con 8 reti realizzate e 12 assist per i compagni.