Gilberto Flores è un difensore del Cincinnati che è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in MLS nel 2025, avendo collezionato 18 presenze, per un totale di 1225 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 12 presenze su 36 giornate ed è subentrato 6 volte.
Flores ha giocato la sua ultima gara il 2 novembre, con il Cincinnati: una sconfitta per 4-0 contro il Columbus Crew, in cui ha giocato 45 minuti. Ha ricevuto 4 cartellini gialli, oltre a essere stato espulso 1 volta.
La gara casalinga contro il Columbus Crew, l'8 novembre, sarà la prossima sfida di MLS per il Cincinnati.
Nell'ultima stagione con Sportivo Trinidense in Division Profesional Flores ha collezionato 25 presenze, fornendo 1 assist.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Cincinnati nel gennaio 2025, Flores ha collezionato 7 presenze in campionato con Libertad, per un totale di 1 assist.