Federico Pereira del Toluca è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Liga MX nel 2025/2026, avendo collezionato 34 presenze, per un totale di 2798 minuti. É partito titolare in 31 di queste presenze, su 36 giornate, ed è entrato a gara in corso 3 volte.
Il difensore ha collezionato la sua ultima presenza il 4 aprile, con il Deportivo Toluca: una sconfitta per 1-0 contro il Querétaro FC, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il difensore ha realizzato 3 reti in questa stagione. Ha ricevuto 9 cartellini gialli.
É stato contro il Club Necaxa il 21 febbraio che Pereira ha segnato il suo ultimo gol, nella vittoria per 3-0. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Club Puebla il 13 settembre, avendo realizzato una rete nella vittoria per 3-1.
La gara casalinga contro l'Atlético San Luis, il 12 aprile, sarà la prossima gara di Liga MX per il Deportivo Toluca.
Nell'ultima stagione con il Deportivo Toluca in Liga MX Pereira ha collezionato 32 presenze, realizzando 1 gol.
Pereira è tornato a giocare con il Deportivo Toluca nel luglio 2025 dopo un'esperienza in prestito con Liverpool, con cui ha collezionato 101 presenze in campionato, con 10 gol segnati.