Facundo Medina è un difensore del Lens che è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Ligue 1 nel 2024/2025, avendo collezionato 29 presenze, per un totale di 2547 minuti. É partito titolare in tutte le 29 presenze, su 34 giornate.
Il difensore ha collezionato la sua ultima presenza il 17 maggio, con il Lens: una vittoria per 4-0 contro il Monaco, in cui ha giocato 89 minuti. In totale il difensore ha fornito 1 assist in questa stagione. Ha ricevuto 13 cartellini gialli, record in questo campionato, oltre a essere stato espulso 1 volta.
Medina ha giocato 31 partite di Ligue 1 nell'ultima stagione con il Lens, realizzando 1 gol e fornendo 3 assist.
Prima di arrivare a vestire la maglia del Lens nel luglio 2020, il difensore ha collezionato 33 presenze in campionato con il Talleres, per un totale di 1 gol e 1 assist.
Il 23 agosto 2020 Medina ha debuttato in Ligue 1, a 21 anni e 87 giorni contro il Nizza. In generale in Ligue 1, ha giocato 147 partite, con 6 gol e 8 assist.