Benjamin Henrichs dell'RB Lipsia ha collezionato 15 presenze, per un totale di 934 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 10 partite su 34 giornate ed è entrato dalla panchina 5 volte.
Henrichs ha giocato la sua ultima gara il 20 dicembre, con l'RB Lipsia: una sconfitta per 5-1 contro il Bayern Monaco, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il difensore ha offerto 2 assist in questa stagione.
Nell'ultima stagione con l'RB Lipsia in Bundesliga Henrichs ha collezionato 33 presenze, realizzando 1 gol e fornendo 5 passaggi vincenti.
A luglio 2020 l'RB Lipsia ha acquisito in prestito Henrichs, al tempo giocatore del Monaco, squadra per cui ha collezionato in totale 35 presenze in campionato, realizzando uno gol e fornendo due assist. Ha siglato il suo trasferimento definitivo come giocatore dell'RB Lipsia a luglio 2021.
Il 20 settembre 2015 Henrichs ha fatto il suo esordio in Bundesliga con il Bayer Leverkusen, an 18 anni e 209 giorni, contro il Borussia Dortmund. La prima presenza con il suo club attuale, l'RB Lipsia, in Bundesliga è stata nella partita contro il Mainz il 20 settembre 2020.
In generale, in Bundesliga, conta 175 presenze con 6 gol segnati e 17 assist per i compagni.